CMD-Центр молекулярной диагностики оказывает широкий спектр лабораторно-диагностических услуг экспертного уровня - с 2008 года на базе Центрального НИИ Эпидемиологии функционируют 8 Референс-центров Роспотребнадзора по мониторингу за возбудителями инфекционных и паразитарных болезней.