Он участвовал в создании систем управления для космической техники и промышленного оборудования, а в МИЭТе готовил инженеров и руководил диссертациями.

Анатолий Васильевич родился в Москве в 1949 году. В 1973 году окончил Московский институт радиотехники, электроники и автоматики. С 1976 по 2004 год работал в НПК «Научный центр», пройдя путь от начальника лаборатории до генерального директора НИИ точного машиностроения.

Зеленоградский НИИТМ Щагин возглавлял в 1999—2004 годах. В этот период предприятие развивало производство телекоммуникационного оборудования, разрабатывало энергосберегающие технологии, автоматические системы, приборы учёта и контроля.

Одним из направлений его научной работы была надёжность бортовых вычислительных систем космических аппаратов. Щагин разрабатывал методы создания отказоустойчивых вычислительных узлов и резервированных каналов связи. С его участием создавали также системы управления станками и оборудованием, автоматику для энергетики, устройства электронного монтажа видеозаписей.

В МИЭТе Анатолий Васильевич возглавлял кафедру систем автоматического управления и контроля, работал профессором Института микроприборов и систем управления. Он создавал учебные программы и лабораторные стенды, преподавал микропроцессорные системы управления, обработку сигналов, информационные сети и телекоммуникации. Его кафедра одной из первых в вузе начала подготовку бакалавров и магистров.

Щагин — автор более 150 научных и учебно-методических работ. Под его руководством защищено более десяти кандидатских диссертаций, выпущено более ста бакалавров и магистров. Он был почётным работником электронной промышленности России, награждён знаком «Почётный наставник».

Дочь Анатолия Васильевича назвала его опорой и гордостью семьи — любимым папой, мужем и дедушкой. «Скорбящие родные сохранят твою любовь и доброту в своих сердцах навечно. Благодарим за каждый день с тобой», — написала она.