Приказ о реорганизации таможенных органов Москвы и Московской области был издан ФТС 8 ноября 2010 года. Московская областная таможня будет осуществлять контроль за складами временного хранения и таможенными складами, находившимися в регионе деятельности Зеленоградской, Ногинской и Щелковской таможен. Также МОТ будет заниматься выдачей новых свидетельств юридическим лицам о включении в Реестр владельцев указанных складов.
Ранее в интервью Zelenograd.ru Раймондас Петровас рассказал о работе таможни и грядущей реорганизации. «Говорить о том, что будут какие-то глобальные изменения, не приходится. Форма управления таможнями останется прежней, просто то, что сегодня существует в трех — будет в одной», сообщил начальник таможни. Также Петровас упомянул, что будет сокращено около 250 должностных лиц. Вместе с тем, в конце прошлого года на таможне имелся ряд вакансий — нужны инспекторы, а также обслуживающий персонал.
В структуре Московской областной таможни функционируют 19 таможенных постов: Вашутинский, Волоколамский, Давыдовский, Дмитровский, Заводской, Каширский, Коломенский, Краснозаводский, Ленинградский, Лобненский, Лыткаринский, Львовский, Мамонтовский, Можайский, Сергиево-Посадский, Ступинский, Сходненский, Черноголовский, а также таможенный пост Кубинка.